El área arqueológica es mencionada por los Cronistas: Joan Santa Cruz Pachacuti Llanque Salcamayhua, Pedro Cieza de León, Betanzos y Garcilaso de la Vega afirmando que estuvo dedicada a Wiracocha y fue un gran centro urbano, que también pudo servir Tambo a las poblaciones que se dirigían del Cusco al Collao o viceversa.
Según El Historiador Víctor Anglés este conjunto Arqueológico fue mandado a edificar por el Inka Wiraqocha para morada y refugio de su padre Yawar Wakaq luego de su fuga en la guerra contra los Chankas.
Pikillaqta es uno de pocos sitios preincas en el Cusco, que ha sido descrito por Cronistas de los siglos XVI Y XVII, viajeros y exploradores y más recientemente por investigadores Sociales.
De acuerdo a la Leyenda de los Hermanos Ayar salieron cuatro grupos de personas de tres cuevas en Pacaritambo, una de estos grupos fue los Maras que migro hasta posicionarse donde en la actualidad se hallan las salineras, y que la sal era su principal fuente de sustento, algunos creen que esta etnia fue la que construyo los andenes circulares de Moray.
Fue reconocido en 1932 por la expedición de Shirppe Johnson, andenes a manera de anillos concéntricos. Cada círculo comprende una terraza que se superpone a otra, formando círculos que van ampliándose. Se puede acceder de uno a otro escalando piedras salientes (sarunas), enclavadas en la pared.
Chinchero de acuerdo al Dr. Jorge Escobar Medrano, podría provenir del termino: Chinchay, que es un felino del area andina importante en la ideología andina y este mismo fue plasmado en el dibujo de Juan Santa Cruz Pachacuti Yanqui Salcamayhua.
Según el lingüista Rodolfo Cerrón-Palomino, Ollantay tiene un origen aimara. Según el mismo, devendría de Ullantawi: La raíz verbal ulla- (‘ver’) deverberado por el morfema -nta (acción hacia abajo o hacia adentro) de por conjunto ullanta- (ver haca abajo, observar), que con el sufijo -wi es donominalizado a «lugar de observación desde lo alto», es decir, atalaya o mirador.
Puka pukara significa «fortaleza roja», porque las piedras calcáreas con las que está construida han adquirido la coloración rojiza del terreno, muy abundante en hierro.